舞台は地球。
地球には司令官オプティマスプライムが率いる6体のオートボットが、悪の軍団・ディセプティコンの出現に備えて身を潜めていた。

破壊大帝メガトロン率いるディセプティコンは、地球に眠るエネルギーを求めて、地球を手に入れようと企んでいた。

そんな中、オートボットたちはひょんなことから3人の人間の子供たちと行動を共にするようになる。
オートボットと子供たちは、強いチームワークでディセプティコンに立ち向かう！

破壊大帝メガトロンの指揮のもと、ディセプティコンは次々と襲い掛かってくる！
果たしてオートボットと子供たちは、地球を守りきることができるのだろうか！？

壮大な戦いが、今、はじまる！！