藤田まことの当たり役・中村主水を主人公にした人気TVシリーズの劇場版第2弾。徳川家に伝わる秘密が隠された屋敷をめぐる仕掛人の壮絶な戦いを描く！

幕末。14代将軍・家茂が逝去し、跡継ぎ慶喜の住む京都に将軍家の密書が運ばれることになる。品川宿で中村主水が警護にあたる中、何者かに密書が奪われてしまった。責任を問われた主水と上司の筆頭同心・田中は、密書奪還のため京都へ。密書に記されていたのは初代将軍・家康が築いた黒谷屋敷に隠されている秘密。屋敷に向かった主水たちを待ち受けていたのは、侵入者を阻む罠がいたるところに仕掛けられたからくり屋敷だった。