ディセプティコン破壊大帝・メガトロンがついに地球に到着する。彼は死者を生き返らせる力があるダークエネルゴンを使って、パワーアップをたくらんでいた。一方オプティマスたちは、クリフジャンパーを救出するために、ディセプティコンの待つエネルゴン採掘場へと向かうが・・・。