オプティマスプライムがまだ若く、オライオンパックスという名前だった頃、メガトロンと彼は仲間だった。かつての友が敵同士になった理由が明らかになる。そして、地球の最深部にたどりついたオプティマスは、ガイアユニクロンのスパークをおさえるため、マトリクスを解放するが・・・。