ジャックたちを人質にとったメガトロンはオメガ・ロックを起動させ、サイバトロン星だけでなく地球をも征服しようとする。絶体絶命のピンチにおちいったオプティマスプライムはある決断をくだす。オートボットとディセプティコンの戦いのゆくえは！？